En absoluto, no es dañino, pero tampoco eficiente, lo que va a pasar es que las ondas electromagnéticas se propagan hacia el conector y rebotan de nuevo hacia la antena por lo que al final vas a recibir menos señal en el aparato, esto sucede siempre que una onda pasa de un medio a otro con distinta impedancia. Simplemente debes fijarte en la frecuencia de diseño la antena, pues están adaptadas con un ROE garantizado, creo que suele ser 1.5 (4% de reflexión).
Si la vas a diseñar tú, es muy importante que fijes unas dimensiones para que trabaje de forma óptima en la banda que quieras escanear, si no te quieres calentar la cabeza, mira las dimensiones de una varilla para que resuene a la frecuencia central de la banda, conforme te acerques al borde de la banda ocurrirá la desadaptacion, y tendrás menos ganancia, pero eso pasa siempre, hasta en las mejores casas, (jajaj) de todas maneras te invito que visites dx.com ahí tienes unas antenas "nagoya" calidad china, pero a un precio estupendo y funcionan muy bárbaras.
El problema lo puedes tener si tiene excesiva reflexión en un transmisor (que no es tu caso, porque hablas de un escaner), porque la potencia regresa a la etapa amplificadora, produciendo su calentamiento y destrucción
, además de disminuir la potencia radiada de la antena.